במהלך הרפליקציה, האנזים האחראי על פירוק זיווג בסיסים (Base- Pairing) בין שני גדילי ה- DNA, ואינו מבצע פירוק קשרים נוסף הוא:
3. הליקאז.
הסבר: במה השאלה עוסקת: אנזימים בתהליך השכפול.
תשובה ג’. האנזים הליקאז (Helicase) מבצע פירוק של קשרי מימן מסוג Base-pairs אשר נמצאים בין נוקלאוטידים מקבילים ב-DNA. כלומר, הוא “פותח” את מבנה ה-Double helix של הדנ”א ומאפשר את היפרדות הדו-גדילים לשני חד-גדילים. בכללי, ה-DNA helicase בנויים בצורת טבעת הקסמרית מ-6 תתי-יחידות זהות שכל אחת מהן פועלת כ-ATPase אשר משמש לשינוי קונפורמציה בתת-היחידה שגורם לתנועת האנזים על גדיל ה-DNA. בפרוקריוטים ההליקאז (שנקרא DnaB) נע על הגדיל מכיוון 5′ ל-3′ שבמהלך השכפול (Replication) גדיל זה נקרא הגדיל המתעכב (Lagging strand). כמו כן, באאוקריוטים ההליקאז (שנקרא Mcm) נע בכיוון 3′ ל-5′ שמתפקד כגדיל המוביל (Leading strand). ההליקאז פועל לא רק בתהליך השכפול אלא גם בתהליכים רבים נוספים כגון בתהליכי תיקון דנ”א רבים (DNA repair), ברקומבינציה הומולוגית (Homologous recombination) כ-RuvB ובתהליך השעתוק (Transcription) כחלק מפקטור השעתוק TFIIH.
שלילת מסיחים:
א’. אקסונוקלאז הינו אנזים, ולעיתים חלק מאנזים, אשר מפרק את הקשרים בין הנוקלאוטידים שבתוך גדיל הדנ”א. קשרים אלו הם קשרים קוולנטים מסוג פוספודיאסטר (Phosphodiester) אשר נמצאים בין הבסיסים החנקניים של אותו חד-גדיל. אקסונוקלאזים מסוג 3′ ל-5′ ,אשר נמצאים על ה-DNA polymerase למשל, משמשים כחלק ממנגנון ה-Proofreading שלו לתיקון טעויות זיווגי בסיסים שהתרחשו במהלך תהליך השכפול. אנזימים אלו אינם מפרקים קשרי מימן מסוג Base-pairs ולכן תשובה זו אינה נכונה.
ב’. כפי נאמר מעל, אקסונוקלאזות מפרקות קשרים קוולנטים מסוג פוספודיאסטר, גם אקסונוקלאזות מסוג 5′ ל-3′ אשר נמצאות למשל על זנב ה-RNA polymerase ומשמשות לפירוק גדיל הרנ”א שמסונתז לאחר שעתוק רצף הטרמינציה עד לסיום פעילותו של ה-RNA polymerase, אינן מפרקות קשרי Base pair ולכן תשובה זו אינה נכונה גם כן.
ד’. האנזים גיראז (Gyrase) הוא אנזים פרוקריוטי מסוג Topoisomerase type II אשר יוצר פיתולים שליליים (Negative supercoil) בדנ”א. אנזים זה משתמש בשני ATP על מנת ליצור שני שברים בגדיל ה-DNA, הקשרים שגיראז שובר הם גם קשרים קוולנטים מסוג פוספודיאסטר (כמו אנזימי האקסונוקלאזות).
להרחבה – Alberts, מהדורה שביעית, ע”מ 261-262 (DNA helicase), עמוד 259 (5′ to 3′ exonuclease) ועמוד 337 (Gyrase).
